Em 1998 é assinado o protocolo de depósito da Colecção Francisco Capelo entre o Estado Português, a Fundação Centro Cultural de Belém e o Coleccionador. A colecção foi depositada no CCB e o Museu do Design inaugurado em 1999.

A criação do Museu motivou ainda a apresentação de exposições temporárias internacionais consagradas ao design.

O crescimento e a excelência deste acervo tornou possível reformular o Museu em 2002, apresentando novas peças e com um novo lay-out- Na mesma data, organizou-se a exposição temporária 7 Ambientes/7 designers que apresentava sete núcleos inteiramente constituídos com peças da colecção, testemunhando a evolução habitacional dos últimos 50 anos do séc. XX.

A colecção foi adquirida pela CML em Dezembro de 2002, mantendo-se o Museu do Design aberto no CCB até Agosto de 2006.